Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms