Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A087X0T9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms