Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn15Q9Z0S5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn15Q9Z0S5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms