Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAMTA1Q9Y6Y1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMTA1Q9Y6Y1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms