Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx1Q9WV80 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx1Q9WV80 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms