Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hsf4Q9R0L1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hsf4Q9R0L1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hsf4Q9R0L1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms