Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms