Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hacd1Q9QY80 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms