Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms