Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaja4Q9JMC3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja4Q9JMC3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms