Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx6Q9JKK1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx6Q9JKK1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms