Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Wdr12Q9JJA4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr12Q9JJA4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms