Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn12Q9ET43 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn12Q9ET43 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms