Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C7

Uncharacterized protein C3orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9C7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D9C7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D9C7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D9C7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D9C7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D9C7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D9C7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D9C7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms