Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms