Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec23bQ9D662 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms