Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snu13Q9D0T1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snu13Q9D0T1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms