Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms