Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3bQ9CZT8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3bQ9CZT8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272.3 ms