Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem50aQ9CXL1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms