Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Sycp2Q9CUU3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Sycp2Q9CUU3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms