Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM2

Kdelr2, ER lumen protein-retaining receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr2Q9CQM2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdelr2Q9CQM2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdelr2Q9CQM2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms