Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4921530L21RikQ9CQ47 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms