Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM79Q9BSE2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM79Q9BSE2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms