Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms