Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q99KU6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q99KU6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q99KU6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q99KU6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q99KU6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q99KU6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q99KU6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q99KU6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q99KU6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q99KU6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q99KU6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q99KU6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q99KU6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q99KU6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q99KU6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q99KU6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q99KU6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q99KU6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q99KU6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q99KU6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q99KU6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q99KU6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q99KU6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q99KU6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q99KU6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q99KU6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q99KU6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Q99KU6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q99KU6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q99KU6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q99KU6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q99KU6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q99KU6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q99KU6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q99KU6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q99KU6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q99KU6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q99KU6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q99KU6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q99KU6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q99KU6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q99KU6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q99KU6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q99KU6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q99KU6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q99KU6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q99KU6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q99KU6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q99KU6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q99KU6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q99KU6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q99KU6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q99KU6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms