Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl3Q91YH5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atl3Q91YH5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms