Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COLGALT1Q8NBJ5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms