Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp20Q8C6M1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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