Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg16l1Q8C0J2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms