Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX7Q7RTT5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX7Q7RTT5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms