Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn11Q6J756 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms