Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Surf4Q64310 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Surf4Q64310 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms