Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp1Q62442 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms