Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a2Q62203 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms