Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha1Q60750 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms