Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d1Q5SSN7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms