Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp28Q5I043 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms