Protein–RNA interactions for Protein: Q497I5

Lce3a, Late cornified envelope 3A, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3aQ497I5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms