Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms