Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms