Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf166Q3U9F6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf166Q3U9F6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms