Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r181Q0P547 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms