Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc2Q05020 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms