Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RelaQ04207 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RelaQ04207 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RelaQ04207 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RelaQ04207 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RelaQ04207 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelaQ04207 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RelaQ04207 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelaQ04207 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelaQ04207 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RelaQ04207 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RelaQ04207 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RelaQ04207 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms