Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 YGL188CYGL188C 174 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 RTA1YGR213C 954 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 ECM34YHL043W 513 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YLR036CYLR036C 612 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 RPS0BYLR048W 759 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 IDP2YLR174W 1239 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YPT7YML001W 627 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 RPS1BYML063W 768 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 POL12YBL035C 2118 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YOL035CYOL035C 303 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YOR022CYOR022C 2148 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 PPQ1YPL179W 1650 nt3.06□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 FAA1YOR317W 2103 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 ERG5YMR015C 1617 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 KTR7YIL085C 1554 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 DAS2YDR020C 699 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 SPI1YER150W 447 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 GRE3YHR104W 984 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 RRT7YLL030C 342 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YLR156WYLR156W 345 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YLR159WYLR159W 345 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YLR161WYLR161W 345 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 RAD17YOR368W 1206 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 NOG1YPL093W 1944 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YGL140CYGL140C 3660 nt3.05□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 PHO87YCR037C 2772 nt3.04□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 FUR1YHR128W 651 nt3.04□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 SOP4YJL192C 705 nt3.04□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 BNA1YJR025C 534 nt3.04□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 TCB3YML072C 4638 nt3.03□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 FMP25YLR077W 1752 nt3.03□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 SEC53YFL045C 765 nt3.03□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YGL132WYGL132W 336 nt3.03□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 OSW1YOR255W 837 nt3.03□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 HCA4YJL033W 2313 nt3.03□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 YPR003CYPR003C 2265 nt3.03□□□□□ -1.92
YHP1Q04116 AIP1YMR092C 1848 nt3.03□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 RPO21YDL140C 5202 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 CDS1YBR029C 1374 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 SSU1YPL092W 1377 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 TMN2YDR107C 2019 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 TRX3YCR083W 384 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 CNN1YFR046C 1086 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 IGO2YHR132W-A 396 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 YJR096WYJR096W 849 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 ELF1YKL160W 438 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 snR37snR37 386 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 VPS45YGL095C 1734 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 APE2YKL157W 2859 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 TFA1YKL028W 1449 nt3.02□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 SSL1YLR005W 1386 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 RAD54YGL163C 2697 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 CWC2YDL209C 1020 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 CPR1YDR155C 489 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 YDR271CYDR271C 372 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 SPO73YER046W 432 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 YER134CYER134C 537 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 YFR045WYFR045W 930 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 YGR051CYGR051C 324 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 COX2Q0250 756 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 PNG1YPL096W 1092 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 FRM2YCL026C-A 582 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 MAD3YJL013C 1548 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 TAF1YGR274C 3201 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 OCT1YKL134C 2319 nt3.01□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 UGA3YDL170W 1587 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 RNA14YMR061W 2034 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 THI22YPR121W 1719 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 YDL183CYDL183C 963 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 PHO13YDL236W 939 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 YDR133CYDR133C 336 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 MSW1YDR268W 1140 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 OSH3YHR073W 2991 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 YHR173CYHR173C 339 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 UIP3YAR027W 708 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 ELO3YLR372W 1038 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 FLD1YLR404W 858 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 COQ5YML110C 924 nt3□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 RPN5YDL147W 1338 nt2.99□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 ASI1YMR119W 1875 nt2.99□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 ARH1YDR376W 1482 nt2.99□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 FDH1YOR388C 1131 nt2.99□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 CDC45YLR103C 1953 nt2.99□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 SRS2YJL092W 3525 nt2.99□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 BUD5YCR038C 1929 nt2.99□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 CDC9YDL164C 2268 nt2.99□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 BUD27YFL023W 2391 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 AIM21YIR003W 2040 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 RGP1YDR137W 1992 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 BDP1YNL039W 1785 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 IES6YEL044W 501 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 YGL152CYGL152C 678 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 DPH1YIL103W 1278 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 CDC8YJR057W 651 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 YAE1YJR067C 426 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 AUR1YKL004W 1206 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 IBD2YNL164C 1056 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 FYV5YCL058C 459 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 ABP140YOR239W 1887 nt2.98□□□□□ -1.93
YHP1Q04116 ENT1YDL161W 1365 nt2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.7 ms