Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou1f1Q00286 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms