Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms