Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk2bP67871 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2bP67871 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms