Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcmtd1P59913 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcmtd1P59913 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms